За допущение коррупционных преступлений и правонарушений во вверенных подразделениях 40 должностных лиц руководящего состава (от заместителя начальника отдела до начальника территориального таможенного органа) привлечены к различным видам дисциплинарной ответственности, вплоть до освобождения от занимаемой должности.
В целях оптимизации структуры таможенных органов Постановлением Правительства Республики Казахстан №965 от 25 августа 2011 года ликвидирована Финансово-хозяйственная таможня Комитета таможенного контроля как подразделение, выполняющее не свойственные для территориальных таможенных органов функции.
В связи с ликвидацией Финансово-хозяйственной таможни Департаментом внутреннего контроля Министерства финансов Республики Казахстан была проведена комплексная проверка её деятельности.
По итогам проверки выявлено нецелевое использование денежных средств на общую сумму более 5,5 млн. тенге. В настоящее время в отношении начальника Финансово-хозяйственной таможни М.Джангозина проводится служебное расследование.
Также сокращена одна из четырех должностей заместителей председателя Комитета таможенного контроля Министерства финансов Республики Казахстан.