Ш. Шегенов окончил Павлодарский государственный университет имени Торайгырова по специальности экономист-менеджер. Работал в управлении Комитета финансового контроля Минфина РК по Павлодарской области, департаменте казначейства области, служил в финансовой полиции Павлодара, возглавлял отдел департамента природных ресурсов и регулирования природопользования.
С 2006 года заместитель начальника, затем руководитель отдела земельных отношений Павлодара.