До этого назначения Ермек Кошербаев занимал должность заместителя акима ВКО и курировал вопросы индустриального и научного направления.
В разные годы Ермек Беделбаевич Кошербаев работал помощником Премьер-Министра РК, заместителем директора общественного «Фонда образования Нурсултана Назарбаева».
Кроме того, он работал руководителем аппарата компаний «КазТрансОйл» и «Транспорт Нефти и Газа», а также был советником первого вице-президента ЗАО НК «КазМунайГаз».
Также занимал должность генерального директора АО «Рауан Меди Групп», руководителем центрального аппарата партии: общественное объединение Республиканская политическая партия «Отан».
В 2009 году стал председателем правления НК «СПК «Ертiс» в городе Семей.