Канат Баедилов родился в 1967 году в Алматинской области. Окончил Алматинский институт народного хозяйства, Казахский национальный университет им. аль-Фараби.
Трудовую деятельность начал в 1991 году старшим контролером–ревизором Контрольно-ревизионного управления по Алматинской области Алматинского областного финансового управления. В разные годы занимал руководящие должности в структурных подразделениях Министерства финансов РК. С мая 2017 года и по настоящее время являлся вице-министром финансов РК.